לפילאטיס מכשירים מספר יתרונות משמעותיים :

1.  עבודה פרטנית בקבוצות קטנות – כלומר בניגוד לפעילות גופנית קבוצתית אחרת, בה יכולים להכנס לשיעור 30, 40, 50 ואפילו 60 מתאמנים – בפילאטיס מספר המתאמנים מוגבל לעד 8 כדי ויצר אינטימיות באימון ויחס מקצועי ואישי ברמה המקסימלית.
2. התאמה אישית לצרכי המתאמן – מאחר ומדובר בקבוצות קטנות, ההדרכה מאפשרת התאמה מיטבית למצבו הרפואי, הפיסי והנפשי של כל מתאמן כדי להגיע לתוצאות מקסימליות.
3. מראה ארוך וחטוב – תרגול פילאטיס מכשירים מקנה למתאמן מראה ארוך, גמיש וחטוב בניגוד לפעילות גופנית אחרת כמו לדוגמא אימון משקולות שמוביל למראה שרירי ומוצק.
4. הרגשה שלא ניתן לתאר במילים – עקב הדיוק בתרגול והשימוש בנשימה ככלי עזר, התחושה בזמן האימון ולאחריו היא תחושת ריחוף פיזי ומנטלי כאחד. 

ועל זה אמר ג'וזף פילאטיס :

 "אחרי 10 שיעורים תרגיש את ההבדל, אחרי 20 שיעורים תראה את ההבדל, ואחרי 30 שיעורים יהיה לך גוף חדש לגמרי.."